ECOGEMS
genotypes of 2058 rice accessions at 8,584,244 SNP sites.
CREP
National Center of Plant Gene Research (Wuhan).
funRiceGenes
A comprehensive database of functionally characterized rice genes.
RTFRD
Rice Transcription Factor Regulation Database is a database of predicted regulatory relationships between transcription factors (TFs) and target genes based on co-expression.
eRice
Epigenetic marks played an essential role in various pathways, including transcription regulation, DNA replication and repair, development and differentiation as well as response to environmental factors.
Rice Gene Index
A comprehensive pan-genome database for comparative and functional genomics of Asian rice. Molecular Plant.
RiceRelativesGD
a genomic database of rice relatives for rice research.
IRIC
The International Rice Informatics Consortium.
rice-genome-hub
A community website that federates genomic data on rice.
SHIGEN
A comprehensive rice science database by japan.
Rice SNP-Seek Database
This site provides Genotype, Phenotype, and Variety Information for rice.
orygenesdb
An interactice tool for rice reverse genetics.
Ensemblolants
International Rice Genome Sequencing Consortium (IRGSP).
CHINA RICE DATA CENTER
中国水稻研究所主办的一个以水稻为主题的大型数据库平台，致力于在育种需求和生物数据之间架构一座桥梁。
Rice Variation Map 2.0
水稻基因组变异及其功能注释的综合数据库.
IC4R
使用大量 RNA-seq 数据进行水稻基因组重新注释.
IRRI
International Rice Research Institute.
OryzaGenome
野生稻种基因组多样性数据库.
OGRO
水稻在线数据库中功能特征基因概述.
HapRice
SNP 单倍型数据库和水稻网络工具.
ricediversity
The Rice Diversity Project.
RiceNavi
水稻定量基因组图谱提供遗传见解并指导育种.
SR4R
水稻基因组育种和群体研究的综合 SNP 资源.
ARMOR
ARMOR – 水稻 miRNA：mRNA 相互作用资源.
OryzaExpress
PlantExpress：集成 OryzaExpress 和 ArthaExpress 的数据库，用于使用基于微阵列的转录组数据进行单物种和跨物种基因表达网络分析.
RED
稻表达数据库 (RED).
RiceENCODE
作为水稻 DNA 元素百科全书的综合表观基因组数据库.
RiceGE
水稻功能基因组表达数据库.
RiceLncPedia
水稻长非编码 RNA 综合数据库.
Rice MPSS
植物 MPSS 数据库：用于分析 mRNA 和小 RNA 的基于特征的转录资源.
TENOR
TENOR：水稻综合 mRNA-Seq 实验数据库.
RECoN
RECoN：用于非生物胁迫响应系统水平分析的水稻环境共表达网络.
RFGB
使用 RFGB v2.0 对水稻复杂性状进行更深入的单倍型挖掘.
RiceCye
Rice Metabolic Pathways: RiceCyc Home.
RiceMetaSysB
RiceMetaSysB：水稻中稻瘟病和白叶枯病反应基因的数据库及其在识别关键抗稻瘟病 WRKY 基因中的应用.
RiTE-db
RiTE 数据库：全属水稻基因组学和进化生物学资源数据库.
RMOS
Rice Microarray Opening Site for Rice Microarray Project.
RTFDB
一种基于网络的水稻转录因子功能预测工具.
RTIMD
水稻 Tos17 插入突变体数据库.
ThRSDB
ThRSDB：泰国大米淀粉成分、分子结构和功能的数据库.
Funricegene
水稻功能基因数据库，最大的优点是查找已报告的所有水稻基因的相关文献.
Rice Information GateWay
籼型/粳型水稻研究的基础平台，系统化和图形化的方式展示了测序的基因组及相关信息.
Rice Genome Annotation Project Database
水稻的基因数据库，包含日本亚种水稻.
The Rice Annotation Project
为科学界提供水稻基因组序列的准确及时的注释，在注释的基础上促进对水稻基因组结构和功能的全面分析.
RiceNet v2
是一款改进的Oryza sativa网络优先级 Web 服务器，主要用于对粳稻进行预测。
RiceFREND
基于大量来自不同生长发育阶段下自然田间条件以及处理了各种植物激素的水稻微阵列数据的基因共表达数据库.
RiceXPro
存储了覆盖水稻整个生长阶段的基因表达资料，包括使用激光显微解剖分离的特定细胞类型.
Rice Pan-genome Browser
水稻泛基因组 包括约370Mbp的IRGSP基因组和约260Mbp的新序列，代表多个水稻种的组合基因组。
Mbkbase
集成数据库，包含水稻的下一代测序数据、种质资源以及各种表型和基因组数据，支持分子育种计划。